东南大学集成电路专业始创于1958年半导体专业，为承担首批国家集成电路人才培养基地的建设任务，2003年12月东南大学成立全国首家集成电路学院。后与电子学院合署建设办公，依托东南大学“电子科学与技术”国家双一流学科开展建设（最新一轮学科评估为最高等级）。2021年东南大学获批全国首批“集成电路科学与工程”一级学科，2022年集成电路学院独立建院，于南京、无锡两地开展人才培养与科学研究。
集成电路是关系国民经济和社会发展的基础性、先导性和战略性产业，学院聚焦集成电路学科前沿，瞄准集成电路“卡脖子”难题，打破学科壁垒，强化交叉融合，突破关键核心技术，培养国家急需人才，支撑我国集成电路事业的自主创新发展。本学科紧扣集成电路产业链关键技术任务，致力于解决器件、设计、制造以及系统集成等方向的核心科学及工程问题；结合集成电路科学前沿和产业重大需求，推动学科基础研究、先导研究和应用研究的有机衔接，注重关键技术和共性技术的突破与应用。学院拥有一支长期坚持在科研第一线，具有丰富教学和科研经验的集成电路师资队伍，学院现有专任教师80余名，其中国家级人才20人次，一批学者在国内外学术组织或专业机构担任要职，此外还聘请集成电路产业教授和校外导师等80余人，联合指导学生的科研实践工作。
学院下设3个国家级科研平台，3个省部级科研平台，近年来，学校在低功耗芯片、高能效智能芯片设计以及mems设计工具等方面研发工作进入国际前沿，中高端智能功率芯片从技术创新到成果落地，实现自主可控，并成功出海，先后牵头获国家级科技奖四次，省部级一等奖八次，同时培养了一大批产业领军及高端创新人才，为中国集成电路事业发展做出了突出贡献。